3.劇烈渦旋震蕩10min。
(此步驟可選用研磨儀,頻率:6.5 m/sec ,處理時(shí)間:30S,10個(gè)循環(huán))
4.14000 rpm離心5 min,轉移上清400 μl到新的1.5 ml的離心管中。
(注意:離心后上清表面可能出現一層雜質(zhì),避免吸取這些雜質(zhì),因為這些雜質(zhì)會(huì )影響下游的擴增
5.加入250 μl S3-Cleanup Buffer,立即徹底混勻。
6.14000 rpm離心2 min,轉移全部上清液(約500 μl)到 預分裝板的孔1、7中。
打開(kāi)核酸自動(dòng)提取儀,選擇編輯程序并命名“environmental samples”,按照下表進(jìn)行編輯。
7. 插入磁棒套,運行編輯好的程序,25min左右程序結束,轉移洗脫孔6、12中的DNA至新的離心管-20℃保存或直接進(jìn)入q-PCR 檢測。
q-PCR檢測
1、非洲豬瘟擴增反應液的配制
取出PCR反應液,室溫融化后,取相應份數(反應液20μl/T、Taq 酶0.2μl/T)混勻,然后向各PCR反應管按20μl分裝;再分別加入 5μl抽提好的DNA模板或陰/陽(yáng)性對照,蓋好管蓋;將反應管置于 全自動(dòng)熒光PCR檢測儀中,參照儀器操作說(shuō)明設定陰/陽(yáng)性對照、 待檢樣本參數進(jìn)行PCR反應,記錄好樣本擺放順序。反應體系如下表:
2、 Q-PCR儀的設置反應程序設定
第一步: 94 °C15分鐘;第二步:95 °C10 秒,55 °C 35 秒,45 個(gè)循環(huán); 熒光素設定為FAM在反應程序的第二步55°C末讀取熒光值。
陰陽(yáng)性判斷:
超寬線(xiàn)性范圍,擴增檢測單拷貝,超高靈敏度